Chloroquin wird zur Behandlung und Bekampfung von akuten Anfallen von bestimmten Stammen von Malaria (eine Infektion der rote Blutkörperchen, die durch einen Mückenstich verursacht ist) angewendet. Es wird auch zur Behandlung einer bestimmten Art von parasitaren durch Protozoon (einzelligen Parasiten) verursachten Leberinfektionen verwendet.